62.000 Menschen sitzen in 184 Gefängnissen in Deutschland in Haft. Jeder Insasse hat das Recht auf einen Alpha-Glaubenskurs. Auch Kirchengemeinden sollen angeregt werden, auf diese Menschen zuzugehen und Seelsorge anzubieten. Der Alpha-Kurs in den Gefängnis fußt auf drei Grundsätzen:

1. -Qualität: Für die Alpha-Kurse sind qualitativ hochwertige Schulungsunterlagen notwendig. Dazu werden alle Ehrenamtlichen beispielsweise in Gesprächsführung geschult und so auf ihr Engagement im Gefängnis vorbereitet.
2. -Kontinuität: Alpha ist eingebettet in die Arbeit der Kirchengemeinde vor Ort. Alpha unterstützt sie, wenn es den Glaubenskurs nicht mehr gibt und bezieht umliegende Vereine und Organisationen mit ein.
3. -Sicherheit: Alpha passt sich vom Ablauf her an die Bedingungen des jeweiligen Gefängnisses an. Auch hier erhalten die Ehrenamtlichen Schulungen, in denen sie über ihre Sicherheit aufgeklärt werden.